“Bērniem ir ziņots par tādām blakusparādībām kā galvassāpes, hiperaktivitāte, reiboņa sajūta un vēdera sāpes, kad tiek izrakstīts melatonīns un izmantots tā licencētām indikācijām. Pētījumos ar bērniem pētījumos netika novērotas nopietnas blakusparādības.
